Отдел редких книг и рукописей — структурное подразделение ГПНТБ СО РАН, осуществляющее научно-исследовательские, методические и координационные функции по разработке проблем истории русской книжной культуры в сибирском и дальневосточном регионе. В состав отдела входят сектор редких книги и рукописей и сектор консервации документов (региональный Центр консервации документов).
Основное направление научно-исследовательской работы отдела редких книг и рукописей: археография на территории Сибири и Дальнего Востока, источниковедение древнерусской литературы, комплексное исследование книжных памятников западно-европейской и кириллической традиции. В соответствии с чем сотрудники отдела ведут работу по выявлению, изучению и введению в научный оборот экземпляров коллекций и собраний редких книг и рукописей сибирских и дальневосточных хранилищ и частных лиц.